Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr18:24132365	C C	G G	1	a0001c0001t0003g0002 a0001c0001t0003g0002	1	HG03139.hp1 HG03139.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1663-120C>G c.1663-120C>G	TTC39C	ENSG00000168234.13	transcript	ENST00000317571.8	protein_coding	13/13		chr18	24132365

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TTC39C_chr18_24009754_24140600 Genic Haplotype Structure on iGV

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Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

Coding Level Haplotype Info (Total: 6)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 51)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 328)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 328)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 49)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1665)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)