Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr3:179708794	C C	T T	2	a0001c0009 a0001c0016 a0001c0009 a0001c0016	3	HG01891.hp1 HG02257.hp1 NA18522.hp1 HG01891.hp1 HG02257.hp1 NA18522.hp1	synonymous_variant	LOW	c.642C>T c.642C>T	p.Cys214Cys p.Cys214Cys	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	6/21	828/8038	642/2592	214/863	chr3	179708794
chr3:179721512	T T	A A	1	a0001c0011 a0001c0011	1	HG02145.hp1 HG02145.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1011T>A c.1011T>A	p.Gly337Gly p.Gly337Gly	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	8/21	1197/8038	1011/2592	337/863	chr3	179721512
chr3:179740366	A A	G G	1	a0001c0012 a0001c0012	1	HG02145.hp2 HG02145.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1374A>G c.1374A>G	p.Leu458Leu p.Leu458Leu	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	11/21	1560/8038	1374/2592	458/863	chr3	179740366
chr3:179742292	G G	A A	2	a0001c0008 a0001c0015 a0001c0008 a0001c0015	4	HG01109.hp2 HG02615.hp1 HG02622.hp1 others(1): Show HG01109.hp2 HG02615.hp1 HG02622.hp1 HG02896.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1476G>A c.1476G>A	p.Thr492Thr p.Thr492Thr	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	12/21	1662/8038	1476/2592	492/863	chr3	179742292
chr3:179754826	C C	G G	3	a0001c0003 a0001c0005 a0001c0009 a0001c0003 a0001c0005 a0001c0009	15	HG01255.hp2 HG01433.hp1 HG01891.hp1 others(12): Show HG01255.hp2 HG01433.hp1 HG01891.hp1 HG02055.hp2 HG02257.hp1 HG02559.hp1 HG02559.hp2 HG02622.hp2 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02886.hp1 HG02965.hp2 HG03453.hp2 HG03516.hp1 NA19043.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1893C>G c.1893C>G	p.Pro631Pro p.Pro631Pro	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	15/21	2079/8038	1893/2592	631/863	chr3	179754826

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chr3:179653133	G G	T T	4	a0001c0002t0040 a0001c0002t0041 a0001c0002t0042 others(1): Show a0001c0002t0040 a0001c0002t0041 a0001c0002t0042 a0001c0002t0043	4	NA18949.hp2 NA18966.hp2 NA18977.hp2 others(1): Show NA18949.hp2 NA18966.hp2 NA18977.hp2 NA18992.hp2	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-93G>T c.-93G>T	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	1/21	93		chr3	179653133
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chr3:179784193	C C	CA CA	6	a0001c0001t0006 a0001c0001t0013 a0001c0001t0019 others(3): Show a0001c0001t0006 a0001c0001t0013 a0001c0001t0019 a0001c0002t0006 a0001c0004t0006 a0001c0006t0006	17	HG00140.hp2 HG00741.hp1 HG01099.hp1 others(14): Show HG00140.hp2 HG00741.hp1 HG01099.hp1 HG01109.hp1 HG01256.hp1 HG01258.hp2 HG02280.hp2 HG02572.hp2 HG02602.hp2 HG02698.hp2 HG02965.hp1 HG03453.hp1 HG03834.hp1 HG04115.hp2 HG04228.hp1 HG06807.hp2 NA18522.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.63dupA c.63dupA	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	21/21	64	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr3	179784193
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chr3:179784438	A A	C C	6	a0001c0001t0005 a0001c0001t0018 a0001c0002t0005 others(3): Show a0001c0001t0005 a0001c0001t0018 a0001c0002t0005 a0001c0003t0005 a0001c0005t0005 a0001c0009t0005	16	HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG02055.hp1 others(13): Show HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG02055.hp1 HG02257.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp2 HG02886.hp1 HG02965.hp2 HG02970.hp2 HG03098.hp1 HG03130.hp2 HG03225.hp1 NA19030.hp1 NA20300.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.297A>C c.297A>C	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	21/21	297		chr3	179784438
chr3:179784892	A A	G G	1	a0001c0003t0039 a0001c0003t0039	1	HG02818.hp1 HG02818.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.751A>G c.751A>G	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	21/21	751		chr3	179784892
chr3:179784908	A A	G G	1	a0001c0001t0038 a0001c0001t0038	1	NA19077.hp2 NA19077.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.767A>G c.767A>G	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	21/21	767		chr3	179784908
chr3:179784909	G G	A A	1	a0001c0001t0021 a0001c0001t0021	1	NA20129.hp2 NA20129.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.768G>A c.768G>A	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	21/21	768		chr3	179784909
chr3:179784948	T T	A A	4	a0001c0001t0006 a0001c0002t0006 a0001c0004t0006 others(1): Show a0001c0001t0006 a0001c0002t0006 a0001c0004t0006 a0001c0006t0006	14	HG00140.hp2 HG00741.hp1 HG01099.hp1 others(11): Show HG00140.hp2 HG00741.hp1 HG01099.hp1 HG01109.hp1 HG01256.hp1 HG01258.hp2 HG02280.hp2 HG02572.hp2 HG02602.hp2 HG02698.hp2 HG02965.hp1 HG03453.hp1 HG04115.hp2 NA18522.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.807T>A c.807T>A	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	21/21	807		chr3	179784948
chr3:179784953	C C	G G	1	a0001c0001t0037 a0001c0001t0037	1	NA19000.hp2 NA19000.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.812C>G c.812C>G	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	21/21	812		chr3	179784953
chr3:179785219	G G	A A	1	a0001c0001t0022 a0001c0001t0022	1	HG02886.hp2 HG02886.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1078G>A c.1078G>A	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	21/21	1078		chr3	179785219
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chr3:179785501	G G	A A	4	a0001c0001t0008 a0001c0002t0008 a0001c0008t0008 others(1): Show a0001c0001t0008 a0001c0002t0008 a0001c0008t0008 a0001c0015t0008	8	HG01070.hp1 HG01071.hp2 HG01109.hp2 others(5): Show HG01070.hp1 HG01071.hp2 HG01109.hp2 HG01169.hp1 HG02622.hp1 HG02723.hp2 HG02738.hp1 HG02896.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1360G>A c.1360G>A	USP13	ENSG00000058056.10	transcript	ENST00000263966.8	protein_coding	21/21	1360		chr3	179785501
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