Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr4:176162121	G G	A A	1	a0023 a0023	1	HG03491.hp1 HG03491.hp1	missense_variant	MODERATE	c.2797G>A c.2797G>A	p.Asp933Asn p.Asp933Asn	WDR17	ENSG00000150627.16	transcript	ENST00000508596.6	protein_coding	21/29	3042/7333	2797/3852	933/1283	chr4	176162121
chr4:176163176	G G	A A	1	a0021 a0021	1	HG02809.hp1 HG02809.hp1	missense_variant	MODERATE	c.2873G>A c.2873G>A	p.Arg958His p.Arg958His	WDR17	ENSG00000150627.16	transcript	ENST00000508596.6	protein_coding	22/29	3118/7333	2873/3852	958/1283	chr4	176163176
chr4:176168688	C C	G G	1	a0014 a0014	1	HG00733.hp2 HG00733.hp2	missense_variant	MODERATE	c.3007C>G c.3007C>G	p.Leu1003Val p.Leu1003Val	WDR17	ENSG00000150627.16	transcript	ENST00000508596.6	protein_coding	23/29	3252/7333	3007/3852	1003/1283	chr4	176168688
chr4:176168694	C C	A A	1	a0009 a0009	6	HG01891.hp2 HG02615.hp2 HG02965.hp2 others(3): Show HG01891.hp2 HG02615.hp2 HG02965.hp2 HG03130.hp1 NA19030.hp1 NA19240.hp2	missense_variant	MODERATE	c.3013C>A c.3013C>A	p.Leu1005Met p.Leu1005Met	WDR17	ENSG00000150627.16	transcript	ENST00000508596.6	protein_coding	23/29	3258/7333	3013/3852	1005/1283	chr4	176168694
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chr4:176177072	G G	T T	1	a0026 a0026	1	NA19043.hp1 NA19043.hp1	missense_variant	MODERATE	c.3464G>T c.3464G>T	p.Arg1155Leu p.Arg1155Leu	WDR17	ENSG00000150627.16	transcript	ENST00000508596.6	protein_coding	27/29	3709/7333	3464/3852	1155/1283	chr4	176177072
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chr4:176137590	A A	G G	1	a0001c0024 a0001c0024	1	HG01175.hp1 HG01175.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1338A>G c.1338A>G	p.Lys446Lys p.Lys446Lys	WDR17	ENSG00000150627.16	transcript	ENST00000508596.6	protein_coding	9/29	1583/7333	1338/3852	446/1283	chr4	176137590
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chr4:176173280	C C	T T	1	a0009c0025 a0009c0025	1	HG02965.hp2 HG02965.hp2	synonymous_variant	LOW	c.3258C>T c.3258C>T	p.Ser1086Ser p.Ser1086Ser	WDR17	ENSG00000150627.16	transcript	ENST00000508596.6	protein_coding	25/29	3503/7333	3258/3852	1086/1283	chr4	176173280

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WDR17_chr4_176060841_176187815 Genic Haplotype Structure on iGV

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Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 27)

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Genebody Level Haplotype Info (Total: 350)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 356)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 21)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)