Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr8:31142628	C C	T T	1	a0008 a0008	6	HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02922.hp2 others(3): Show HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02922.hp2 HG03098.hp2 HG03195.hp2 NA19030.hp1	missense_variant&splice_region_variant	MODERATE	c.3236C>T c.3236C>T	p.Ser1079Leu p.Ser1079Leu	WRN	ENSG00000165392.11	transcript	ENST00000298139.7	protein_coding	27/35	3476/7575	3236/4299	1079/1432	chr8	31142628
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chr8:31067041	C C	T T	24	a0001c0001 a0001c0015 a0001c0018 others(21): Show a0001c0001 a0001c0015 a0001c0018 a0001c0033 a0002c0002 a0002c0019 a0002c0034 a0002c0037 a0003c0014 a0004c0006 a0004c0031 a0005c0008 a0005c0012 a0005c0022 a0006c0011 a0006c0035 a0007c0007 a0009c0017 a0011c0036 a0012c0021 a0013c0023 a0014c0020 a0017c0030 a0019c0032	169	HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp1 others(166): Show HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00423.hp1 HG00423.hp2 HG00621.hp1 HG00735.hp1 HG00735.hp2 HG00738.hp1 HG00738.hp2 HG01070.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01071.hp2 HG01106.hp2 HG01109.hp1 HG01109.hp2 HG01123.hp1 HG01123.hp2 HG01168.hp1 HG01168.hp2 HG01192.hp1 HG01192.hp2 HG01256.hp1 HG01258.hp2 HG01346.hp2 HG01496.hp1 HG01496.hp2 HG01515.hp1 HG01517.hp2 HG01884.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp1 HG01928.hp2 HG01934.hp1 HG01934.hp2 HG01978.hp1 HG01981.hp2 HG02027.hp2 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02056.hp1 HG02056.hp2 HG02080.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02135.hp2 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02165.hp2 HG02257.hp1 HG02258.hp2 HG02273.hp2 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02293.hp1 HG02300.hp1 HG02451.hp1 HG02572.hp1 HG02615.hp1 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02683.hp2 HG02698.hp1 HG02698.hp2 HG02717.hp1 HG02717.hp2 HG02735.hp2 HG02809.hp1 HG02818.hp1 HG02965.hp2 HG02976.hp2 HG03017.hp2 HG03098.hp1 HG03139.hp2 HG03195.hp1 HG03209.hp2 HG03225.hp1 HG03239.hp1 HG03239.hp2 HG03453.hp2 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03516.hp1 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG03579.hp1 HG03654.hp2 HG03669.hp2 HG03688.hp1 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03704.hp2 HG03710.hp2 HG03834.hp2 HG03927.hp2 HG04115.hp2 HG04199.hp1 HG04199.hp2 HG04204.hp1 HG04228.hp1 HG04228.hp2 HG06807.hp2 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18906.hp2 NA18939.hp1 NA18939.hp2 NA18945.hp1 NA18948.hp1 NA18948.hp2 NA18951.hp1 NA18955.hp1 NA18955.hp2 NA18957.hp1 NA18959.hp1 NA18959.hp2 NA18960.hp1 NA18966.hp1 NA18966.hp2 NA18968.hp1 NA18968.hp2 NA18971.hp1 NA18971.hp2 NA18975.hp1 NA18977.hp1 NA18977.hp2 NA18978.hp1 NA18978.hp2 NA18979.hp1 NA18979.hp2 NA18980.hp1 NA18980.hp2 NA18983.hp1 NA18983.hp2 NA18988.hp1 NA18988.hp2 NA18993.hp1 NA18993.hp2 NA18994.hp1 NA18994.hp2 NA19002.hp1 NA19002.hp2 NA19003.hp2 NA19011.hp1 NA19011.hp2 NA19078.hp1 NA19078.hp2 NA19079.hp1 NA19080.hp1 NA19081.hp2 NA19084.hp1 NA19084.hp2 NA19086.hp2 NA19087.hp1 NA19087.hp2 NA19088.hp2 NA19090.hp1 NA19240.hp1 NA20129.hp1 NA20300.hp1 NA20905.hp2 NA21309.hp1	synonymous_variant	LOW	c.513C>T c.513C>T	p.Cys171Cys p.Cys171Cys	WRN	ENSG00000165392.11	transcript	ENST00000298139.7	protein_coding	6/35	753/7575	513/4299	171/1432	chr8	31067041
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chr8:31090838	T T	C C	2	a0001c0033 a0009c0017 a0001c0033 a0009c0017	3	HG02109.hp1 HG03516.hp1 HG03540.hp1 HG02109.hp1 HG03516.hp1 HG03540.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1725T>C c.1725T>C	p.Tyr575Tyr p.Tyr575Tyr	WRN	ENSG00000165392.11	transcript	ENST00000298139.7	protein_coding	15/35	1965/7575	1725/4299	575/1432	chr8	31090838
chr8:31090901	T T	C C	2	a0001c0033 a0009c0017 a0001c0033 a0009c0017	3	HG02109.hp1 HG03516.hp1 HG03540.hp1 HG02109.hp1 HG03516.hp1 HG03540.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1788T>C c.1788T>C	p.Ser596Ser p.Ser596Ser	WRN	ENSG00000165392.11	transcript	ENST00000298139.7	protein_coding	15/35	2028/7575	1788/4299	596/1432	chr8	31090901
chr8:31096822	C C	T T	1	a0002c0037 a0002c0037	1	HG03486.hp2 HG03486.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1953C>T c.1953C>T	p.Gly651Gly p.Gly651Gly	WRN	ENSG00000165392.11	transcript	ENST00000298139.7	protein_coding	17/35	2193/7575	1953/4299	651/1432	chr8	31096822
chr8:31111767	T T	G G	1	a0001c0018 a0001c0018	2	HG02257.hp1 NA18522.hp1 HG02257.hp1 NA18522.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2241T>G c.2241T>G	p.Leu747Leu p.Leu747Leu	WRN	ENSG00000165392.11	transcript	ENST00000298139.7	protein_coding	19/35	2481/7575	2241/4299	747/1432	chr8	31111767
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Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 264)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 13)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 10)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 77)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1420)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)