Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr4:372251	T T	C C	9	a0001c0001t0007g0256 a0001c0001t0007g0257 a0001c0001t0007g0258 others(6): Show a0001c0001t0007g0256 a0001c0001t0007g0257 a0001c0001t0007g0258 a0001c0001t0007g0260 a0001c0001t0007g0263 a0001c0001t0113g0261 a0001c0001t0114g0262 a0001c0001t0115g0255 a0001c0001t0116g0259	9	HG02647.hp1 HG02809.hp2 HG02896.hp1 others(6): Show HG02647.hp1 HG02809.hp2 HG02896.hp1 HG02897.hp2 HG02922.hp2 HG03130.hp1 HG03471.hp1 NA19240.hp1 NA19240.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.227-413T>C c.227-413T>C	ZNF141	ENSG00000131127.14	transcript	ENST00000240499.8	protein_coding	3/3		chr4	372251
chr4:372278	G G	T T	1	a0001c0001t0129g0130 a0001c0001t0129g0130	1	HG02922.hp1 HG02922.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.227-386G>T c.227-386G>T	ZNF141	ENSG00000131127.14	transcript	ENST00000240499.8	protein_coding	3/3		chr4	372278
chr4:372629	T T	C C	5	a0001c0001t0017g0232 a0001c0001t0017g0233 a0001c0001t0017g0235 others(2): Show a0001c0001t0017g0232 a0001c0001t0017g0233 a0001c0001t0017g0235 a0001c0001t0097g0234 a0001c0001t0098g0231	5	HG02886.hp2 HG03669.hp1 HG03704.hp1 others(2): Show HG02886.hp2 HG03669.hp1 HG03704.hp1 HG04184.hp2 HG04228.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.227-35T>C c.227-35T>C	ZNF141	ENSG00000131127.14	transcript	ENST00000240499.8	protein_coding	3/3		chr4	372629

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ZNF141_chr4_332814_389868 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 9)

Coding Level Haplotype Info (Total: 11)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 164)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 311)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 338)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 8)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 2)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 188)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 579)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)