Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr19:57211814	C C	T T	1	a0001c0003 a0001c0003	13	HG02055.hp2 HG02258.hp1 HG02559.hp2 others(10): Show HG02055.hp2 HG02258.hp1 HG02559.hp2 HG02647.hp1 HG02717.hp1 HG02886.hp2 HG02976.hp2 HG03139.hp1 HG03195.hp1 HG03225.hp2 HG03453.hp1 NA19043.hp2 NA19240.hp2	synonymous_variant	LOW	c.717C>T c.717C>T	p.Thr239Thr p.Thr239Thr	ZNF264	ENSG00000083844.11	transcript	ENST00000263095.10	protein_coding	4/4	1131/12163	717/1884	239/627	chr19	57211814
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chr19:57217054	A A	T T	1	a0001c0001t0076 a0001c0001t0076	1	HG04199.hp2 HG04199.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4073A>T c.4073A>T	ZNF264	ENSG00000083844.11	transcript	ENST00000263095.10	protein_coding	4/4	4073		chr19	57217054
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chr19:57217427	C C	T T	1	a0009c0010t0065 a0009c0010t0065	1	HG03130.hp2 HG03130.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4446C>T c.4446C>T	ZNF264	ENSG00000083844.11	transcript	ENST00000263095.10	protein_coding	4/4	4446		chr19	57217427
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chr19:57217487	G G	A A	2	a0001c0001t0018 a0001c0001t0067 a0001c0001t0018 a0001c0001t0067	4	NA18957.hp2 NA19055.hp2 NA19063.hp1 others(1): Show NA18957.hp2 NA19055.hp2 NA19063.hp1 NA19089.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4506G>A c.4506G>A	ZNF264	ENSG00000083844.11	transcript	ENST00000263095.10	protein_coding	4/4	4506		chr19	57217487
chr19:57217587	G G	T T	3	a0001c0001t0009 a0001c0001t0036 a0001c0001t0083 a0001c0001t0009 a0001c0001t0036 a0001c0001t0083	10	HG02145.hp2 HG02258.hp2 HG02559.hp1 others(7): Show HG02145.hp2 HG02258.hp2 HG02559.hp1 HG02622.hp1 HG02886.hp1 HG02896.hp2 HG03486.hp2 HG06807.hp2 NA18906.hp1 NA18906.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4606G>T c.4606G>T	ZNF264	ENSG00000083844.11	transcript	ENST00000263095.10	protein_coding	4/4	4606		chr19	57217587
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chr19:57217769	A A	G G	1	a0006c0009t0049 a0006c0009t0049	1	HG02109.hp2 HG02109.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4788A>G c.4788A>G	ZNF264	ENSG00000083844.11	transcript	ENST00000263095.10	protein_coding	4/4	4788		chr19	57217769
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ZNF264_chr19_57186500_57227846 Genic Haplotype Structure on iGV

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Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 10)

Coding Level Haplotype Info (Total: 17)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 131)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 206)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 356)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 10)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 6)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 147)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 257)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)