Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr19:9296360	A A	C C	1	a0001c0010 a0001c0010	1	NA21309.hp1 NA21309.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1044T>G c.1044T>G	p.Ser348Ser p.Ser348Ser	ZNF699	ENSG00000196110.8	transcript	ENST00000591998.6	protein_coding	6/6	1538/6758	1044/1929	348/642	chr19	9296360
chr19:9296792	G G	A A	1	a0001c0004 a0001c0004	4	HG02559.hp1 HG02630.hp1 HG02895.hp1 others(1): Show HG02559.hp1 HG02630.hp1 HG02895.hp1 HG02897.hp2	synonymous_variant	LOW	c.612C>T c.612C>T	p.Phe204Phe p.Phe204Phe	ZNF699	ENSG00000196110.8	transcript	ENST00000591998.6	protein_coding	6/6	1106/6758	612/1929	204/642	chr19	9296792
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chr19:9305078	T T	C C	2	a0001c0003 a0001c0004 a0001c0003 a0001c0004	20	HG01109.hp2 HG02257.hp2 HG02559.hp1 others(17): Show HG01109.hp2 HG02257.hp2 HG02559.hp1 HG02572.hp2 HG02630.hp1 HG02717.hp1 HG02818.hp1 HG02895.hp1 HG02897.hp2 HG02970.hp1 HG03041.hp1 HG03041.hp2 HG03098.hp1 HG03209.hp1 HG03225.hp2 NA18522.hp2 NA18978.hp1 NA18981.hp1 NA19043.hp2 NA19240.hp1	synonymous_variant	LOW	c.42A>G c.42A>G	p.Arg14Arg p.Arg14Arg	ZNF699	ENSG00000196110.8	transcript	ENST00000591998.6	protein_coding	2/6	536/6758	42/1929	14/642	chr19	9305078

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ZNF699_chr19_9286140_9314838 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 5)

Coding Level Haplotype Info (Total: 10)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 76)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 203)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 394)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 4)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 52)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 189)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)