Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr19:37537795	G G	A A	1	a0001c0009 a0001c0009	1	NA19065.hp1 NA19065.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1137G>A c.1137G>A	p.Lys379Lys p.Lys379Lys	ZNF793	ENSG00000188227.14	transcript	ENST00000627814.3	protein_coding	8/8	1579/7117	1137/1221	379/406	chr19	37537795

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chr19:37537938	A A	G G	1	a0001c0001t0128 a0001c0001t0128	1	NA18983.hp1 NA18983.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.59A>G c.59A>G	ZNF793	ENSG00000188227.14	transcript	ENST00000627814.3	protein_coding	8/8	59		chr19	37537938
chr19:37537943	A A	G G	1	a0001c0001t0128 a0001c0001t0128	1	NA18983.hp1 NA18983.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.64A>G c.64A>G	ZNF793	ENSG00000188227.14	transcript	ENST00000627814.3	protein_coding	8/8	64		chr19	37537943
chr19:37537946	T T	C C	1	a0001c0001t0128 a0001c0001t0128	1	NA18983.hp1 NA18983.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.67T>C c.67T>C	ZNF793	ENSG00000188227.14	transcript	ENST00000627814.3	protein_coding	8/8	67		chr19	37537946
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chr19:37537972	C C	T T	2	a0001c0001t0046 a0001c0001t0127 a0001c0001t0046 a0001c0001t0127	3	HG01346.hp2 HG01952.hp1 HG02148.hp1 HG01346.hp2 HG01952.hp1 HG02148.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.93C>T c.93C>T	ZNF793	ENSG00000188227.14	transcript	ENST00000627814.3	protein_coding	8/8	93		chr19	37537972
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chr19:37538068	T T	C C	6	a0001c0001t0009 a0001c0001t0034 a0001c0001t0062 others(3): Show a0001c0001t0009 a0001c0001t0034 a0001c0001t0062 a0001c0001t0063 a0001c0001t0124 a0001c0001t0125	15	HG01167.hp1 HG01169.hp1 HG01891.hp1 others(12): Show HG01167.hp1 HG01169.hp1 HG01891.hp1 HG01928.hp2 HG01993.hp2 HG02004.hp2 HG02083.hp2 HG02132.hp1 HG02293.hp2 HG02630.hp1 HG03195.hp2 HG04115.hp2 NA18978.hp2 NA18993.hp1 NA19030.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.189T>C c.189T>C	ZNF793	ENSG00000188227.14	transcript	ENST00000627814.3	protein_coding	8/8	189		chr19	37538068
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chr19:37538078	A A	AT AT	6	a0001c0001t0016 a0001c0001t0029 a0001c0001t0033 others(3): Show a0001c0001t0016 a0001c0001t0029 a0001c0001t0033 a0001c0001t0122 a0003c0004t0023 a0003c0004t0033	14	HG00140.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 others(11): Show HG00140.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01071.hp2 HG01106.hp1 HG01167.hp2 HG01175.hp2 HG01192.hp1 HG01361.hp1 HG01496.hp2 HG03654.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.209dupT c.209dupT	ZNF793	ENSG00000188227.14	transcript	ENST00000627814.3	protein_coding	8/8	210	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr19	37538078
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ZNF793_chr19_37501939_37548333 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 8)

Coding Level Haplotype Info (Total: 11)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 147)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 310)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 390)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 7)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 107)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 297)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)