Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr9:32450045	T T	C C	7	a0001c0008 a0001c0010 a0001c0011 others(4): Show a0001c0008 a0001c0010 a0001c0011 a0001c0022 a0001c0025 a0001c0026 a0002c0007	14	HG01192.hp2 HG01243.hp1 HG01891.hp2 others(11): Show HG01192.hp2 HG01243.hp1 HG01891.hp2 HG02486.hp1 HG02717.hp2 HG02723.hp1 HG02818.hp2 HG03098.hp1 HG03139.hp2 HG03195.hp1 HG03209.hp1 HG03453.hp2 HG03516.hp1 NA20129.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2604T>C c.2604T>C	p.Asp868Asp p.Asp868Asp	ACO1	ENSG00000122729.19	transcript	ENST00000309951.8	protein_coding	21/21	2719/7443	2604/2670	868/889	chr9	32450045

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chr9:32384651	A A	G G	5	a0001c0001t0108 a0001c0001t0110 a0001c0011t0106 others(2): Show a0001c0001t0108 a0001c0001t0110 a0001c0011t0106 a0001c0011t0107 a0001c0019t0109	5	HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02723.hp2 others(2): Show HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02723.hp2 HG02976.hp1 HG03516.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-107A>G c.-107A>G	ACO1	ENSG00000122729.19	transcript	ENST00000309951.8	protein_coding	1/21	20856		chr9	32384651
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ACO1_chr9_32379643_32459769 Genic Haplotype Structure on iGV

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Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 15)

Coding Level Haplotype Info (Total: 29)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 145)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 353)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 382)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 15)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 7)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 97)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 710)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)